(一)個人獨資企業(yè)強調投資主體為自然人外商獨資企業(yè)強調投資主體來自境外，可以是境外自然人、境外公司、其他境外經(jīng)濟組織、無國籍人等。

(二)個人獨資企業(yè)非法人主體，投資者到企業(yè)承擔無限責任，外商獨資企業(yè)是法人主體，投資者是企業(yè)承擔有限責任，是外國自然人投資的，一般都是一個人有限責任公司。

(三)個人獨資企業(yè)不交企業(yè)所得稅，投資者會按個體工商戶經(jīng)營按五級累進稅率對超額收入繳納個人所得稅，外商獨資企業(yè)繳納企業(yè)所得稅。

(四)設立外商投資企業(yè)有單獨的要求，如：必須有利于中國國民經(jīng)濟的發(fā)展，采用先進的技術和設備，或全部或大部分產品出口。設立外商獨資企業(yè)，必須獲得國務院授權對外經(jīng)濟貿易部長部門或國務院機關審查批準，國外投資者可向工商行政管理機關登記申請憑批準文件，領取營業(yè)執(zhí)照。個人獨資企業(yè)的設立條件比較寬松，設立手續(xù)也比較簡單：只要有合法的企業(yè)名稱，有投資者申報的出資，有固定的生產經(jīng)營場地和必要的生產經(jīng)營條件和必要的員工，企業(yè)登記機關應在法定的期限內給予登記。除非個人獨資企業(yè)從事的業(yè)務是法律規(guī)定的，行政法規(guī)經(jīng)相關部門批準的企業(yè)，無需向登記機關提交批準文件。